| 順位 | 選手名 | 所属名 | レーン | タイム | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 出 島 茂 幸 | 専修大学 | IN | 04:10.20 | |
| 2 | 佐 山 敏 幸 | 池田高校 | IN | 04:14.77 | |
| 3 | 松 岡 源 季 | 早稲田大学 | IN | 04:18.35 | |
| 4 | 小 野 泰 幸 | 白樺学園高校 | OUT | 04:18.83 | |
| 5 | 黒 坂 宏 哉 | 日本大学 | OUT | 04:19.08 | |
| 6 | 吉 野 和 紀 | 標茶高校 | OUT | 04:22.57 | |
| 7 | 森 年 成 | 本別高校 | OUT | 04:23.44 | |
| 8 | 下 地 研 | 釧路商業高校 | IN | 04:23.78 | |
| 9 | 新 田 昌 樹 | 白樺学園高校 | IN | 04:24.66 | |
| 10 | 蓑 田 翔 | 白樺学園高校 | OUT | 04:24.90 | |
| 11 | 永 原 巧 | 池田高校 | IN | 04:24.91 | |
| 12 | 池 川 茂 雄 | 厚真高校 | IN | 04:27.08 | |
| 13 | 松 山 隆 多 | 池田高校 | OUT | 04:27.11 | |
| 14 | 土 屋 槙 吾 | 白樺学園高校 | OUT | 04:28.18 | |
| 15 | 中 山 裕 大 | 釧路商業高校 | OUT | 04:30.88 | |
| 16 | 福 岡 裕 也 | 釧路商業高校 | IN | 04:31.04 |