| 順位 | 選手名 | 所属名 | レーン | タイム | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 佐々木 裕 剛 | 早来中学校 | OUT | 00:39.48 | CR |
| 2 | 加 藤 連 | 厚真中学校 | IN | 00:40.54 | |
| 3 | 佐 々 洋 太 | 千歳向陽台中学 | OUT | 00:41.49 | |
| 4 | 竹 田 翔 平 | 早来中学校 | OUT | 00:41.88 | |
| 5 | 工 藤 幸 司 | 穂別中学校 | IN | 00:41.96 | |
| 6 | 大 道 龍 一 | 浦河第二中学校 | OUT | 00:42.19 | |
| 7 | 池 田 大 輝 | 浦河第一中学校 | IN | 00:42.54 | |
| 8 | 堂 下 貴 章 | 門別中学校 | OUT | 00:43.57 | |
| 9 | 新井田 知 輝 | 鵡川中学校 | IN | 00:45.12 | |
| 10 | 西 紀 彦 | 浦河第二中学校 | IN | 00:46.74 | |
| 11 | 桑 島 悠 輔 | 浦河第二中学校 | IN | 00:49.00 | |
| 12 | 西 昭 彦 | 浦河第二中学校 | OUT | 00:50.02 | |
| 13 | ウイリアムソン 貢 裕 | 浦河第二中学校 | OUT | 00:51.74 | |
| 14 | 春 藤 健 太 | 静内中学校 | IN | 01:04.15 |