| 順位 | 選手名 | 所属名 | レーン | タイム | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 佐々木 裕 剛 | 早来中学校 | IN | 00:40.20 | |
| 2 | 加 藤 連 | 厚真中学校 | OUT | 00:41.38 | |
| 3 | 佐 々 洋 太 | 千歳向陽台中学 | IN | 00:42.00 | |
| 4 | 工 藤 幸 司 | 穂別中学校 | OUT | 00:42.64 | |
| 5 | 竹 田 翔 平 | 早来中学校 | IN | 00:42.79 | |
| 6 | 大 道 龍 一 | 浦河第二中学校 | IN | 00:42.93 | |
| 7 | 堂 下 貴 章 | 門別中学校 | IN | 00:43.56 | |
| 8 | 新井田 知 輝 | 鵡川中学校 | OUT | 00:44.28 | |
| 9 | 池 田 大 輝 | 浦河第一中学校 | OUT | 00:44.99 | |
| 10 | 西 紀 彦 | 浦河第二中学校 | OUT | 00:46.10 | |
| 11 | 桑 島 悠 輔 | 浦河第二中学校 | OUT | 00:48.37 | |
| 12 | 西 昭 彦 | 浦河第二中学校 | IN | 00:50.23 | |
| 13 | 春 藤 健 太 | 静内中学校 | OUT | 00:51.85 | |
| 14 | ウイリアムソン 貢 裕 | 浦河第二中学校 | IN | 00:52.04 |